13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0119 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0119  putative type IV secretion system protein IcmJ/DotN  100 
 
 		 239 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1807  IcmJ protein  31.29 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0375  IcmJ  31.29 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0521  hypothetical protein  28.49 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0497  hypothetical protein  27.96 
 
 		 208 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  35.35 
 
 		 436 aa  53.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 422 aa  53.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 408 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0879  HNH endonuclease family protein  31.25 
 
 		 182 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00646503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1310  HNH nuclease  36 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.944782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  35.94 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>