153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1080 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  100 
 
 
228 aa  474  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  77.88 
 
 
232 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1052  HNH endonuclease domain protein  74.56 
 
 
187 aa  267  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  57.52 
 
 
230 aa  263  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  51.94 
 
 
206 aa  215  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  54.79 
 
 
321 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  49.32 
 
 
560 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  27.69 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  37.5 
 
 
387 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  34.52 
 
 
362 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  32.95 
 
 
357 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  37.5 
 
 
356 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  35.63 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  32.95 
 
 
407 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  31.82 
 
 
392 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  28.44 
 
 
361 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  30.56 
 
 
346 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  27.52 
 
 
368 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  37.5 
 
 
357 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  35.29 
 
 
179 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  31.82 
 
 
370 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  32.35 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  30.77 
 
 
370 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  30.1 
 
 
374 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  29.52 
 
 
382 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  35.29 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  35.29 
 
 
416 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  39.06 
 
 
358 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  33.82 
 
 
368 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  35.94 
 
 
370 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  35.29 
 
 
359 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  28.57 
 
 
334 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  38.71 
 
 
386 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  47.62 
 
 
162 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  37.5 
 
 
379 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  36.92 
 
 
81 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  39.68 
 
 
372 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  35.63 
 
 
322 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  40 
 
 
420 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  45 
 
 
81 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  43.86 
 
 
177 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  37.31 
 
 
127 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  36.99 
 
 
384 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  36.99 
 
 
357 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  33.82 
 
 
362 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  38.71 
 
 
359 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  48.98 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  48.98 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  44.62 
 
 
418 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  35.48 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  43.08 
 
 
417 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  35.48 
 
 
372 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  47.83 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  40 
 
 
80 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  40 
 
 
80 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  45.61 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  37.5 
 
 
185 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  46.94 
 
 
185 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  41.51 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  44.9 
 
 
189 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  46.94 
 
 
189 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  29.76 
 
 
357 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  41.94 
 
 
390 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  46.94 
 
 
185 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  39.62 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  40.32 
 
 
391 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  28.95 
 
 
123 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  31.63 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  39.62 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  38.6 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  45.28 
 
 
146 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  30.12 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  41.3 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  36.11 
 
 
355 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  40.32 
 
 
391 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  40.32 
 
 
388 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  38.71 
 
 
336 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  42.86 
 
 
418 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  47.06 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  38.71 
 
 
316 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  40.32 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  40.32 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  38.71 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  40.32 
 
 
309 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  31.71 
 
 
234 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  40.32 
 
 
390 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  35.9 
 
 
388 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  44.9 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  39.13 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  45.65 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  38.1 
 
 
387 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  43.48 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  39.13 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.74 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  44.9 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  38.71 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  42.31 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 
190 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  41.82 
 
 
163 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  42.86 
 
 
190 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>