45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0677 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  100 
 
 		 309 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  64.17 
 
 		 309 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 163 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 80 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 80 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 166 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 177 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 81 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  28.26 
 
 		 842 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  43.75 
 
 		 120 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  43.75 
 
 		 120 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.78 
 
 		 165 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  32.77 
 
 		 167 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  33.87 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  21.38 
 
 		 226 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 170 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  35.96 
 
 		 116 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  27.36 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 168 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  37.31 
 
 		 218 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  35.59 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  34.92 
 
 		 168 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  32.76 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 197 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  28.85 
 
 		 181 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 173 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 169 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 190 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 189 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  34.92 
 
 		 189 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>