42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3155 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  100 
 
 		 330 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  54.35 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  53.6 
 
 		 226 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 237 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  51.35 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  57.83 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  55.56 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  46.3 
 
 		 220 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  53.09 
 
 		 116 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 240 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  41.59 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 84 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  41.86 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  33.98 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  36.07 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  39.08 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  39.33 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  47.17 
 
 		 122 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 223 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  38.27 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  34.25 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  30.43 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  28.21 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  37.21 
 
 		 419 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  28.89 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 200 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  32.05 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  32 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  39.22 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  34.15 
 
 		 118 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 515 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 177 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  33.33 
 
 		 309 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  26.74 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  56.67 
 
 		 549 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  29.87 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  27.63 
 
 		 271 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>