27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0150 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  100 
 
 
223 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  39.17 
 
 
309 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  41.32 
 
 
407 aa  91.7  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  48.19 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  40 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  36.44 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2730  hypothetical protein  38.96 
 
 
85 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  34.09 
 
 
340 aa  55.1  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  33.33 
 
 
330 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  31.82 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  40.28 
 
 
303 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  31.11 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  28.71 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  30.77 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  36.49 
 
 
291 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  36.49 
 
 
291 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  28.68 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  27.66 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  33.78 
 
 
334 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  31.43 
 
 
290 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  28.77 
 
 
318 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  29.13 
 
 
367 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  34.21 
 
 
290 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  34.21 
 
 
290 aa  42  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  34.21 
 
 
290 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  33.77 
 
 
268 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>