33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4584 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  100 
 
 		 84 aa  174  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  49.4 
 
 		 282 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 237 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 330 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  50.79 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  44.59 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  39.02 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  39.51 
 
 		 242 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  52.63 
 
 		 260 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  47.54 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  36 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  49.12 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  49.18 
 
 		 240 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  50.88 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  32.43 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  40.26 
 
 		 348 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 395 aa  52.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 279 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 388 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 436 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  43.4 
 
 		 419 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 408 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0706  HNH endonuclease  48.72 
 
 		 255 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.543261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 549 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 471 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 471 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  33.93 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  50 
 
 		 200 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  40.32 
 
 		 568 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 515 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>