30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0017 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  100 
 
 		 282 aa  588  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  41.46 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  47.19 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  49.4 
 
 		 84 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 330 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  56.06 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  43.02 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  47.37 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  53.62 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  56.9 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  40.66 
 
 		 116 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  43.01 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  26.04 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  34.44 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  43.94 
 
 		 419 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 560 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 560 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  35 
 
 		 177 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  22.51 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  53.12 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  35 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  28.43 
 
 		 268 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  31.75 
 
 		 309 aa  42  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>