28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0601 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  100 
 
 		 240 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  57.94 
 
 		 116 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  44.26 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  41.41 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  55.56 
 
 		 330 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  51.85 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  51.55 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  51.22 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  56.34 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  45.56 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  39.02 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  56.9 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  41.49 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  40.43 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  47.54 
 
 		 84 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  48.53 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  45.59 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  20.9 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  39.33 
 
 		 395 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  43.4 
 
 		 122 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  35.96 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  32.98 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  36.14 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  28.18 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  32.93 
 
 		 311 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  26.89 
 
 		 367 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 282 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>