33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0546 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  39.17 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  39.37 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 367 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  47.25 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  43.4 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  42.06 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  36.84 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  37.98 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  49 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  36.22 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  32.38 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  27.37 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  38.52 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  35.78 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  40.71 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  40.24 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  40.28 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  40.28 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  42.19 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  28.18 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  28.28 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  28.89 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  37.93 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  41.38 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0038  Helix-turn-helix domain protein  32.26 
 
 		 120 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000109438  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  27.17 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>