38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3090 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  100 
 
 		 367 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  57.27 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  54.46 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  52.25 
 
 		 213 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  53.27 
 
 		 247 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  55.96 
 
 		 224 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  48.41 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  29.45 
 
 		 267 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  43.22 
 
 		 212 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  48.6 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  48.74 
 
 		 253 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  51.06 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  44 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  42.99 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  40.78 
 
 		 281 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  36.23 
 
 		 261 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  39.42 
 
 		 270 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 266 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  39 
 
 		 268 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3280  hypothetical protein  52.63 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  54.24 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  37.96 
 
 		 285 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  47.62 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 109 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1412  hypothetical protein  32.11 
 
 		 239 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  30 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 282 aa  49.7  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0650  hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.809152  hitchhiker  0.00228707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  27.47 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  27.1 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  24.39 
 
 		 226 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  26.74 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  26.51 
 
 		 240 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>