37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48770 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  47.06 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  53.27 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  43.84 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  51.43 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  52.25 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  49.55 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  50.98 
 
 		 281 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  44.74 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  45.95 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  51.35 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  45.36 
 
 		 314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 267 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  44.04 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  36.84 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  40.59 
 
 		 270 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  56.45 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  36.75 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  36.75 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  45.07 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  29.3 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  53.85 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  46.43 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  29.66 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  24.48 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  27.78 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  35 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  28.18 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4907  hypothetical protein  57.69 
 
 		 40 aa  42  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  27.62 
 
 		 260 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  23.08 
 
 		 330 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>