30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4750 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  45.45 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  38.97 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  46.94 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  45.1 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  37.32 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  51.65 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  39.52 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  41.18 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  40.78 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  47.52 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  41.41 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  47.52 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  36 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  29.05 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  34.68 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  38.52 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  31.19 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  33.61 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  36 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  33.61 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  34.91 
 
 		 426 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4907  hypothetical protein  48.39 
 
 		 40 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  32.53 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  26.13 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  26.76 
 
 		 371 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>