44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1765 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  100 
 
 		 240 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  58.56 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  54.05 
 
 		 116 aa  122  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  44.26 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  42.61 
 
 		 277 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  42.59 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  53.09 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  55 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  36.19 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  32.59 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  49.18 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  31.86 
 
 		 395 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  36.36 
 
 		 348 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  31.08 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  41.79 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 323 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 387 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  36.67 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  36.67 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 388 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  33.73 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  35 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  27.85 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  51.52 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  37.5 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  28.77 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  34.15 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  31.25 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 515 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  26.51 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  32.53 
 
 		 407 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  32.61 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 143 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>