36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0354 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  100 
 
 		 340 aa  699    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  25.89 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  25.89 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  31 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  34.09 
 
 		 223 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  41.79 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1723  HNH endonuclease  30.7 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  30.34 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  31.4 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  36.76 
 
 		 290 aa  53.5  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  25.49 
 
 		 283 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  33.71 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  32.98 
 
 		 240 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  28.72 
 
 		 291 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  28.72 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  21.56 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  28.41 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  28.7 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  32.58 
 
 		 278 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  38.98 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  28.21 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  33.02 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  29.36 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  31.71 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  34.62 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  31.33 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  26.76 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  34.55 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  31.03 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  28.77 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  28.83 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  21.68 
 
 		 387 aa  42.7  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>