96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5076 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  58.25 
 
 		 298 aa  332  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  44.41 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  40.27 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  38.14 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  36.46 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  42.11 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  35.27 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  36.11 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  33.91 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  33.56 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  35.27 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  34.93 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  34.59 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  31.58 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  36.73 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  27.59 
 
 		 323 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  30.5 
 
 		 374 aa  89  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  28.72 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  27.37 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  31.49 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  29.47 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  27.56 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  33.33 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  31.87 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  34.62 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  24.36 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  32.43 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  34.17 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  26.94 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  41.46 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  35 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  42.86 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3491  SRA-YDG domain-containing protein  28.25 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.205725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  30.89 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  28.8 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  29.03 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  30.24 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  43.59 
 
 		 426 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  42.68 
 
 		 435 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  42.68 
 
 		 435 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  43.59 
 
 		 441 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  29.27 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 424 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  45.07 
 
 		 426 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  45.07 
 
 		 430 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  45.07 
 
 		 430 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  35.29 
 
 		 445 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  45.07 
 
 		 430 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  35.29 
 
 		 445 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  46.38 
 
 		 440 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  32.73 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  36.67 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  36.67 
 
 		 438 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  46.38 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  45.9 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  27.08 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  45.9 
 
 		 434 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  27.12 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  36.56 
 
 		 434 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  42.31 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  35.56 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  37.96 
 
 		 466 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  35 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  28.23 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  45.07 
 
 		 481 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  33.87 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  41.46 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  37.5 
 
 		 489 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  45.9 
 
 		 480 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  38.96 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  35.78 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  40.26 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  33.87 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  31.91 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1229  SRA-YDG domain protein  32.5 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  29.36 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  42.25 
 
 		 418 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  27.83 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  47.46 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  32.12 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  40.98 
 
 		 436 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  34.31 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  30.58 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1577  SRA-YDG domain-containing protein  38.03 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  31.4 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  25.19 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  34.21 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 223 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  26.97 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>