106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0040 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  884    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  73 
 
 
436 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  68.63 
 
 
441 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  68.4 
 
 
426 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  66.97 
 
 
418 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  67.69 
 
 
434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  67.69 
 
 
445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  67.69 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  67.69 
 
 
445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  67.92 
 
 
426 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  67.92 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  67.45 
 
 
430 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  67.45 
 
 
430 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  59.87 
 
 
489 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  67.06 
 
 
436 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  66.59 
 
 
438 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  66.59 
 
 
438 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  65.65 
 
 
434 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  67.55 
 
 
435 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  67.55 
 
 
435 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  62.7 
 
 
466 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  61.59 
 
 
480 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  61.32 
 
 
481 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  66.83 
 
 
440 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  66.51 
 
 
437 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  66.94 
 
 
256 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1866  hypothetical protein  64.36 
 
 
320 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  72.54 
 
 
142 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  27.88 
 
 
441 aa  120  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2402  hypothetical protein  71.05 
 
 
116 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  26.84 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  32.08 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  46.94 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  26.01 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  49.48 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  25.33 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  24.8 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  36.69 
 
 
494 aa  77  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  38.1 
 
 
661 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  37.11 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  38.52 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  36.6 
 
 
255 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  41.51 
 
 
464 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  39.8 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  64.58 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  31.22 
 
 
414 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  36.51 
 
 
469 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  39.33 
 
 
561 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  25.27 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  28.79 
 
 
414 aa  63.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  36.73 
 
 
546 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  24.53 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  32 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  38.46 
 
 
504 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  41.1 
 
 
222 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  41.1 
 
 
508 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  35.29 
 
 
620 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  35.11 
 
 
627 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  36.19 
 
 
572 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  36 
 
 
620 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  41.1 
 
 
556 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  35.62 
 
 
585 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  30.77 
 
 
566 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  38.36 
 
 
507 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  35.62 
 
 
568 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  35.58 
 
 
540 aa  53.5  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.95 
 
 
530 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2722  HNH nuclease  35.65 
 
 
571 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  42.67 
 
 
495 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  42.67 
 
 
497 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  42.67 
 
 
518 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  29.76 
 
 
391 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  37.65 
 
 
437 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  35.29 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  34.31 
 
 
531 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  41.33 
 
 
513 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  35.66 
 
 
526 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0795  hypothetical protein  40.3 
 
 
552 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  39.44 
 
 
551 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40.58 
 
 
628 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.78 
 
 
535 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0743  hypothetical protein  40.3 
 
 
553 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1011  hypothetical protein  44.44 
 
 
564 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  25.75 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4442  HNH endonuclease  40.62 
 
 
567 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  30.36 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0994  HNH nuclease  34.71 
 
 
153 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  35.8 
 
 
499 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1075  hypothetical protein  32.47 
 
 
558 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128214  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  32.38 
 
 
605 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  38.37 
 
 
505 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2806  HNH endonuclease  38.96 
 
 
582 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  34.34 
 
 
567 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0461  HNH endonuclease  33.65 
 
 
575 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0792  hypothetical protein  42.59 
 
 
553 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1070  hypothetical protein  34.43 
 
 
554 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.495852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  33.33 
 
 
584 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  36.49 
 
 
535 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1416  HNH endonuclease  39.44 
 
 
582 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  34.31 
 
 
290 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>