141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1865 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  100 
 
 
142 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  96.48 
 
 
434 aa  265  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  89.44 
 
 
438 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  89.44 
 
 
438 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  87.32 
 
 
436 aa  245  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  84.96 
 
 
445 aa  234  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  84.96 
 
 
445 aa  234  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  84.21 
 
 
441 aa  235  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  83.46 
 
 
426 aa  234  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  84.21 
 
 
430 aa  233  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  84.21 
 
 
430 aa  233  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  84.21 
 
 
426 aa  233  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  91.73 
 
 
437 aa  233  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  84.21 
 
 
434 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  84.21 
 
 
430 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  83.46 
 
 
430 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  91.73 
 
 
435 aa  229  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  91.73 
 
 
435 aa  229  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  75.35 
 
 
418 aa  229  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  87.97 
 
 
440 aa  223  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  87.97 
 
 
256 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  77.86 
 
 
466 aa  216  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  77.86 
 
 
489 aa  215  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  72.54 
 
 
436 aa  215  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  76.81 
 
 
436 aa  205  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  77.86 
 
 
480 aa  199  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  77.86 
 
 
481 aa  199  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  49.35 
 
 
441 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  35.66 
 
 
494 aa  71.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  42.53 
 
 
485 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  45.78 
 
 
458 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  45.21 
 
 
469 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  43.04 
 
 
661 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  45.57 
 
 
464 aa  67  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  45.24 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  43.42 
 
 
414 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  47.44 
 
 
504 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  43.06 
 
 
561 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  41.67 
 
 
546 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  53.23 
 
 
472 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  44.29 
 
 
255 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  45.21 
 
 
408 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  44.78 
 
 
432 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  43.84 
 
 
507 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  42.47 
 
 
442 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  38.36 
 
 
585 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  41.56 
 
 
572 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  60.42 
 
 
341 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  37.33 
 
 
620 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  45.21 
 
 
413 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  36.99 
 
 
566 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  37.18 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2722  HNH nuclease  42.31 
 
 
571 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265119  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  36.99 
 
 
568 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  38.96 
 
 
414 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  41.03 
 
 
627 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  41.67 
 
 
391 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  38.36 
 
 
508 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  37.23 
 
 
414 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  39.51 
 
 
556 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  38.27 
 
 
499 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  43.66 
 
 
417 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  43.66 
 
 
418 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  39.47 
 
 
513 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.36 
 
 
535 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  38.2 
 
 
620 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  35.9 
 
 
584 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  38.03 
 
 
580 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  43.66 
 
 
418 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  42.47 
 
 
407 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  38.16 
 
 
518 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  39.44 
 
 
558 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  38.16 
 
 
497 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  38.03 
 
 
605 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  39.44 
 
 
580 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  39.44 
 
 
551 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.62 
 
 
530 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  46.81 
 
 
200 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  36.84 
 
 
495 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  41.94 
 
 
540 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  41.94 
 
 
437 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1416  HNH endonuclease  43.94 
 
 
582 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2806  HNH endonuclease  43.94 
 
 
582 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4442  HNH endonuclease  42.19 
 
 
567 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0461  HNH endonuclease  38.3 
 
 
575 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  41.94 
 
 
531 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0994  HNH nuclease  39.02 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.497036  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  41.94 
 
 
532 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  39.19 
 
 
535 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  43.48 
 
 
290 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.68 
 
 
628 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1011  hypothetical protein  44.44 
 
 
564 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0743  hypothetical protein  44.44 
 
 
553 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49119  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  37.35 
 
 
526 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2991  HNH nuclease  38.46 
 
 
584 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.76476  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  28.12 
 
 
304 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0795  hypothetical protein  44.44 
 
 
552 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1075  hypothetical protein  44.44 
 
 
558 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  36.14 
 
 
505 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2447  HNH endonuclease  42.42 
 
 
592 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>