45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0977 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  46.81 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  37.66 
 
 		 435 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  37.66 
 
 		 435 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  46.81 
 
 		 426 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  44.68 
 
 		 438 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  44.68 
 
 		 438 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  44.68 
 
 		 434 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  46.81 
 
 		 441 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  46.81 
 
 		 426 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  46.81 
 
 		 434 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  46.81 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  46.81 
 
 		 445 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  38.96 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  46.81 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  46.81 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  46.81 
 
 		 445 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 330 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  44.68 
 
 		 436 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 395 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2811  HNH endonuclease  31.93 
 
 		 355 aa  46.6  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  44.68 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  44.68 
 
 		 440 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  44.68 
 
 		 437 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  42.11 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  52.5 
 
 		 126 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  38.71 
 
 		 480 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  42.55 
 
 		 466 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  38.71 
 
 		 489 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  50 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  50 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0879  HNH endonuclease family protein  38.24 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00646503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  42.55 
 
 		 481 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  40.43 
 
 		 418 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 436 aa  42.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1738  HNH nuclease  42.55 
 
 		 582 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.425954  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  46.88 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  40.43 
 
 		 436 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  31.82 
 
 		 549 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  54.05 
 
 		 422 aa  41.6  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  30.86 
 
 		 278 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  50 
 
 		 84 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0346  hypothetical protein  34.62 
 
 		 146 aa  41.2  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  50 
 
 		 282 aa  41.2  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>