234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  72.64 
 
 		 580 aa  745    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  67.48 
 
 		 535 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  70.3 
 
 		 580 aa  707    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  100 
 
 		 558 aa  1100    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  67.02 
 
 		 499 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  79.35 
 
 		 584 aa  805    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  44.62 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  65.52 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  55.92 
 
 		 628 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  36.56 
 
 		 603 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  34.45 
 
 		 585 aa  190  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  34.68 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.06 
 
 		 602 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  31.26 
 
 		 620 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  32.33 
 
 		 568 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  52.14 
 
 		 714 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  48.37 
 
 		 508 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  47.26 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  40.8 
 
 		 507 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  46.56 
 
 		 222 aa  123  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  31.98 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  29.8 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  29.51 
 
 		 516 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  40.88 
 
 		 485 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  33.81 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  28.78 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  40.15 
 
 		 426 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  43.31 
 
 		 521 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  29.08 
 
 		 567 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  38.17 
 
 		 567 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  41.04 
 
 		 443 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  38.06 
 
 		 469 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 360 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  31.89 
 
 		 443 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  28.46 
 
 		 512 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  34.97 
 
 		 546 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  30.65 
 
 		 502 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 561 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  43.86 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  24.63 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  28.63 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  25.06 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  25.06 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  37.04 
 
 		 572 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  29.69 
 
 		 480 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  34.73 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40.16 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  29.45 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  29.45 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  36.15 
 
 		 743 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  38.52 
 
 		 228 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  26.21 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  23.45 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  23.45 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  47 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  34.67 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  26.82 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  23.45 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  27.91 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.51 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  39.13 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  27.91 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  28.46 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  37.69 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.51 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  35.88 
 
 		 709 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  29.95 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  32.59 
 
 		 432 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  32.81 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  30.33 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  35.15 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  29.44 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  40.96 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  29.44 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  26.13 
 
 		 555 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  35.43 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  30.59 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  33.09 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  32.99 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  32.99 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  38.21 
 
 		 512 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  53.03 
 
 		 593 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  48.24 
 
 		 581 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  53.03 
 
 		 593 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  48.24 
 
 		 581 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  30.04 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  39.29 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  37.93 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  45.88 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  45.88 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  45.88 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  53.03 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  42.67 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  34.27 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  24.77 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  32.24 
 
 		 404 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 627 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>