152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2332 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  100 
 
 
620 aa  1202    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  36.95 
 
 
505 aa  190  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  37.35 
 
 
526 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  27.03 
 
 
546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  47.79 
 
 
661 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  49.49 
 
 
485 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  50.52 
 
 
469 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  41.58 
 
 
561 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  40.91 
 
 
469 aa  97.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  44.94 
 
 
627 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  40.17 
 
 
572 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  43.14 
 
 
408 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  44.12 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  34.73 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  38.26 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  43.3 
 
 
418 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  34.51 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  32.91 
 
 
432 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  46.51 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  40.21 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  43.3 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  34.45 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  34.45 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  40.2 
 
 
414 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  40.2 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  40.7 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  37.93 
 
 
436 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  35.48 
 
 
530 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  35.51 
 
 
441 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  36.07 
 
 
436 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  37.07 
 
 
435 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  37.07 
 
 
435 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  37.07 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  32.41 
 
 
538 aa  62.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  37.07 
 
 
426 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  36.21 
 
 
440 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  32.28 
 
 
391 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  36.21 
 
 
434 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  36.21 
 
 
430 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  37.07 
 
 
441 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  36.21 
 
 
430 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  36.21 
 
 
445 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  36.21 
 
 
430 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  36.21 
 
 
445 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  31.58 
 
 
585 aa  61.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  36.21 
 
 
426 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  36.21 
 
 
256 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  35.29 
 
 
436 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  37.61 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  36.75 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  36.75 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  32.03 
 
 
526 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  36.21 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  29.82 
 
 
566 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  39.44 
 
 
580 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.57 
 
 
512 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  36.89 
 
 
472 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  32.03 
 
 
577 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  26.46 
 
 
498 aa  58.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  38.03 
 
 
551 aa  58.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  39.44 
 
 
580 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  39.44 
 
 
605 aa  57.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  39.44 
 
 
584 aa  57.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  39.44 
 
 
558 aa  57.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  30.7 
 
 
620 aa  57.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  39.44 
 
 
499 aa  57.4  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  36.89 
 
 
418 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  24.7 
 
 
490 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  39.44 
 
 
535 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  23.19 
 
 
444 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  31.71 
 
 
568 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  32.82 
 
 
535 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  35.8 
 
 
628 aa  54.7  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  48.98 
 
 
535 aa  54.3  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  38.38 
 
 
480 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  38.38 
 
 
489 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  38.38 
 
 
466 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  32.74 
 
 
433 aa  53.9  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  23.19 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  33.63 
 
 
440 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  23.19 
 
 
444 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  38.38 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  30.8 
 
 
504 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  32.74 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  31.71 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  42.86 
 
 
310 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  32.74 
 
 
428 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  32.74 
 
 
433 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  32.74 
 
 
433 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  29.2 
 
 
522 aa  52  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  38.2 
 
 
142 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  33.63 
 
 
436 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  37.33 
 
 
714 aa  51.6  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  30.53 
 
 
524 aa  51.2  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  23.81 
 
 
448 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  34.95 
 
 
341 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  24.04 
 
 
473 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  32.22 
 
 
602 aa  50.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 
572 aa  50.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1075  hypothetical protein  40.79 
 
 
558 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.128214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>