145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3785 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  100 
 
 
498 aa  981    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  48.01 
 
 
535 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.37 
 
 
443 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  27.88 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  43.92 
 
 
635 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  30.23 
 
 
567 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  28.87 
 
 
484 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.13 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  48.42 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  48.42 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  48.42 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  29.24 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  43.8 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  26.58 
 
 
516 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  49.46 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  49.46 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  29.8 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  44.79 
 
 
582 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  46.67 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  48.45 
 
 
578 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  29.8 
 
 
511 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  47.96 
 
 
578 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  27.27 
 
 
530 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  47.42 
 
 
593 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  47.42 
 
 
593 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  45.83 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.51 
 
 
580 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  45.83 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  43.56 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  42.86 
 
 
593 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  25.54 
 
 
508 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  42.86 
 
 
601 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  27.88 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  27.88 
 
 
508 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  44.79 
 
 
601 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  42.86 
 
 
514 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.84 
 
 
499 aa  73.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  42.86 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  42.86 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  42.86 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  42.86 
 
 
516 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  43.75 
 
 
571 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  45.36 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  45.92 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  45.92 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  45.05 
 
 
714 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  40.87 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  42.55 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  27.53 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  42.59 
 
 
550 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  40.48 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.61 
 
 
535 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  48.65 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.43 
 
 
556 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  42.55 
 
 
539 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  43.75 
 
 
586 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  28.66 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  39.64 
 
 
546 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  43.88 
 
 
516 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  27.94 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  38.58 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  28.8 
 
 
434 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  28.8 
 
 
434 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.41 
 
 
507 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  48.53 
 
 
551 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  27.21 
 
 
519 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  41.24 
 
 
519 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  39.81 
 
 
605 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  50 
 
 
603 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  31.88 
 
 
469 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  26.46 
 
 
620 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  28.53 
 
 
434 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.05 
 
 
558 aa  63.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  42.35 
 
 
506 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  35.94 
 
 
473 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  28.01 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  30.11 
 
 
584 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  47.06 
 
 
580 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  28.79 
 
 
411 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  45.45 
 
 
620 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  29.16 
 
 
377 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  29.16 
 
 
377 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  25.36 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  39.02 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.12 
 
 
620 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2194  hypothetical protein  84.38 
 
 
61 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  26.72 
 
 
405 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  39.19 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  42.22 
 
 
565 aa  58.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  28.35 
 
 
430 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  28.35 
 
 
430 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  27.11 
 
 
404 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  27.23 
 
 
426 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  35.35 
 
 
464 aa  57  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  40 
 
 
748 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  43.06 
 
 
441 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  42.86 
 
 
434 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  40 
 
 
494 aa  55.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  26.46 
 
 
403 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  28.26 
 
 
566 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>