47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01940 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1046    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  59.12 
 
 		 522 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  55.36 
 
 		 538 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  56.5 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  56.83 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  47.31 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  39.74 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  36.67 
 
 		 414 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  36.62 
 
 		 414 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  39 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 255 aa  133  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  27.01 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.12 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  30.09 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  31.72 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  36.5 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  36.69 
 
 		 627 aa  74.3  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  32.61 
 
 		 661 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  24.46 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  26.56 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  37.96 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.56 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.13 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  26.11 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  33.58 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  28.87 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  25.66 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  30.53 
 
 		 620 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  24.92 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  30.6 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  25.28 
 
 		 551 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  25.44 
 
 		 524 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  23.91 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  28.36 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  25.79 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  28.95 
 
 		 499 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  28.15 
 
 		 440 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  25.61 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  27.61 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  27.61 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  29.23 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  30.37 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  33.68 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  24.63 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  29.69 
 
 		 505 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  29.59 
 
 		 490 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>