49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  776    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  45.08 
 
 		 522 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  42.82 
 
 		 577 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  43.34 
 
 		 538 aa  286  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  41.78 
 
 		 526 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  41.05 
 
 		 524 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  42.08 
 
 		 535 aa  273  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  32.23 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  29.94 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  31.88 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  31.21 
 
 		 255 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  31.86 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  37.4 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  29.47 
 
 		 572 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  40.19 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  29.72 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  39.25 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  30 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  32.29 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  33.07 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  32.9 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  24.47 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  24.8 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  24.8 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  25.19 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  25.73 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  24.6 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  25.19 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  24.68 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  24.68 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  24.48 
 
 		 473 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  24.54 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  24.34 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  24.28 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  26.52 
 
 		 499 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  31.94 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  30.63 
 
 		 540 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  29.09 
 
 		 532 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  29.09 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  29.86 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  26.49 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  25.58 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  24.41 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  24.41 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  26.25 
 
 		 518 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  45.28 
 
 		 307 aa  42.7  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>