125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0179 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  899    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  88.61 
 
 
492 aa  797    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  87.24 
 
 
446 aa  785    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  87.82 
 
 
473 aa  785    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  88.26 
 
 
444 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  80.23 
 
 
448 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  899    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  88.61 
 
 
492 aa  797    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  87.24 
 
 
492 aa  788    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  87.82 
 
 
473 aa  785    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  88.26 
 
 
444 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  94.13 
 
 
490 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  83.98 
 
 
493 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  88.51 
 
 
473 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  88.04 
 
 
444 aa  797    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  80.83 
 
 
447 aa  700    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  79.54 
 
 
448 aa  689    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  45.58 
 
 
464 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  44.24 
 
 
489 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  41.39 
 
 
497 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  44.47 
 
 
506 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  41.25 
 
 
495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  43.75 
 
 
501 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  42.98 
 
 
507 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  42.98 
 
 
507 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  39.96 
 
 
513 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  42.09 
 
 
552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  39.35 
 
 
518 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  43.02 
 
 
508 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  42.54 
 
 
507 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  42.54 
 
 
507 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  42.54 
 
 
507 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  43.22 
 
 
510 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  42.54 
 
 
519 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  42.54 
 
 
507 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  42.54 
 
 
519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  41.12 
 
 
454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  42.12 
 
 
508 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  41.26 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  41.07 
 
 
451 aa  302  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  42.13 
 
 
499 aa  295  9e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  42.13 
 
 
454 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  41.74 
 
 
355 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  43.22 
 
 
317 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  33.7 
 
 
593 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  35.53 
 
 
532 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  35.51 
 
 
531 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  34.55 
 
 
540 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  36.76 
 
 
437 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  33.33 
 
 
533 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  31.42 
 
 
551 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  32.84 
 
 
534 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  33.69 
 
 
553 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  34.22 
 
 
524 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  45.23 
 
 
239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  44.12 
 
 
240 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  82.76 
 
 
87 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  82.35 
 
 
87 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  82.35 
 
 
87 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.83 
 
 
561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  28.07 
 
 
432 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  28.07 
 
 
546 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  29.51 
 
 
442 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  28.63 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.77 
 
 
469 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  31.58 
 
 
485 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  44.33 
 
 
158 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  30.57 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  26.86 
 
 
572 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  28.5 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  32.79 
 
 
627 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  29.56 
 
 
661 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  36.36 
 
 
260 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  27.39 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  36.36 
 
 
222 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  35.62 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  27.51 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  30.5 
 
 
464 aa  66.6  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  27.17 
 
 
275 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  27.14 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  26.28 
 
 
433 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  26.77 
 
 
428 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  50 
 
 
494 aa  63.5  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  27.12 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  29.26 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  37.8 
 
 
222 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  26.02 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  26.85 
 
 
440 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  26.46 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  26.39 
 
 
505 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  25.55 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  25.62 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  46.03 
 
 
458 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  24.38 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  26 
 
 
413 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  26.69 
 
 
526 aa  50.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  23.51 
 
 
620 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  26.32 
 
 
577 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.06 
 
 
605 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  25.3 
 
 
526 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>