125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0348 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  88.61 
 
 
442 aa  797    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  999    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  94.39 
 
 
446 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  93.85 
 
 
473 aa  873    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  93.95 
 
 
444 aa  855    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  83.8 
 
 
448 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  88.61 
 
 
442 aa  797    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  999    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  93.33 
 
 
492 aa  914    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  93.85 
 
 
473 aa  873    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  93.95 
 
 
444 aa  855    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  85.57 
 
 
490 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  93.14 
 
 
493 aa  910    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  93.85 
 
 
473 aa  875    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  94.17 
 
 
444 aa  861    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  82.57 
 
 
447 aa  726    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  84.37 
 
 
448 aa  739    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  46.27 
 
 
464 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  44.84 
 
 
489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  41.99 
 
 
497 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  45.23 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  44.2 
 
 
501 aa  329  7e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  41.31 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  43.54 
 
 
507 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  43.54 
 
 
507 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  42.58 
 
 
508 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  41.16 
 
 
513 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  43.11 
 
 
552 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  43.1 
 
 
510 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  43.54 
 
 
519 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  43.11 
 
 
507 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  43.11 
 
 
507 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  43.11 
 
 
507 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  42.67 
 
 
511 aa  315  9e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  43.11 
 
 
519 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  43.14 
 
 
508 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  42.89 
 
 
507 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  40.36 
 
 
518 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  40.99 
 
 
454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  41.12 
 
 
451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  41.72 
 
 
499 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  41.94 
 
 
454 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  45.57 
 
 
317 aa  229  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  42.49 
 
 
355 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  34.4 
 
 
593 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  34.8 
 
 
532 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  36.28 
 
 
437 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  34.55 
 
 
540 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  35.47 
 
 
531 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  34.33 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  33.83 
 
 
534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  31.42 
 
 
551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  33.69 
 
 
553 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  47.95 
 
 
239 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  34.28 
 
 
524 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  46.91 
 
 
240 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  88.24 
 
 
87 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  88.24 
 
 
87 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  89.29 
 
 
87 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.72 
 
 
561 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  30.56 
 
 
442 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  28.17 
 
 
546 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  27.56 
 
 
432 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  29.44 
 
 
387 aa  97.8  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  35.53 
 
 
469 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.02 
 
 
485 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  32.12 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  27.04 
 
 
572 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  45.36 
 
 
158 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  36.07 
 
 
627 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  34.1 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  33.13 
 
 
260 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  30.19 
 
 
661 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  34.78 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  34.34 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  29.2 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  35.62 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  34.16 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  33.73 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  36.03 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  29.37 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  34.42 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  30.33 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  27.17 
 
 
275 aa  67  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  27.01 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  26.64 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  48.33 
 
 
494 aa  63.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  36.96 
 
 
222 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  27.27 
 
 
505 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  26.18 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  28 
 
 
418 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  26.28 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  46.77 
 
 
458 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  26.65 
 
 
417 aa  57.4  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  25.89 
 
 
413 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  39.8 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  25.89 
 
 
407 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  25.68 
 
 
526 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28.93 
 
 
605 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.5 
 
 
426 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>