70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1050    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  46.53 
 
 		 522 aa  412  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  47.31 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  45.45 
 
 		 526 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  44.55 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  43.63 
 
 		 538 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  40.36 
 
 		 384 aa  273  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  35.14 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  34.91 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  36.44 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  37.01 
 
 		 255 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  30.84 
 
 		 442 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  29.37 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  28.04 
 
 		 494 aa  91.3  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  27.63 
 
 		 432 aa  90.5  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  27.59 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.32 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  30.2 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.52 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  36.5 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  36.5 
 
 		 572 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  26.19 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  28.45 
 
 		 408 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  26.98 
 
 		 546 aa  70.5  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30.89 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.1 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  26.64 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  34.35 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  24.86 
 
 		 551 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  30.38 
 
 		 540 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  34 
 
 		 454 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  34 
 
 		 499 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  24.31 
 
 		 553 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  28.42 
 
 		 418 aa  51.2  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  26.9 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  26.9 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  40.91 
 
 		 505 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  28.57 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  24.57 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  30.28 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  26.05 
 
 		 444 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  24.23 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  24.23 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  24.23 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  31.37 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  25.57 
 
 		 447 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  24.23 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  25.24 
 
 		 448 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  27.1 
 
 		 418 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  37.5 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  24.14 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  25.71 
 
 		 513 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  30.56 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  26.33 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  31.63 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  25.09 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  29.2 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  24.92 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  23.89 
 
 		 507 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  25.71 
 
 		 518 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  23.89 
 
 		 507 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  24.76 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  26.95 
 
 		 566 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 519 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  25.27 
 
 		 510 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  24.42 
 
 		 524 aa  43.5  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  25.85 
 
 		 444 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  25.85 
 
 		 444 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>