144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1708 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  100 
 
 		 519 aa  1046    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  38.85 
 
 		 566 aa  263  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  34.27 
 
 		 567 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  31.26 
 
 		 480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  31.26 
 
 		 480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  31.03 
 
 		 480 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  32.49 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  29 
 
 		 508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  29 
 
 		 508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  33.52 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  28.75 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  29.96 
 
 		 512 aa  125  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  29.95 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.68 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  30.03 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  29.43 
 
 		 524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  30.13 
 
 		 517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  25.94 
 
 		 546 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  27.95 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  27.95 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  28.17 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  29.05 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  27.95 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  27.95 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  27.73 
 
 		 516 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  36.3 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  28.45 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  28.12 
 
 		 532 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.21 
 
 		 567 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  30.1 
 
 		 550 aa  100  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  31.51 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.84 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  25 
 
 		 579 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  36.31 
 
 		 566 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 585 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.94 
 
 		 499 aa  87  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  29.46 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.1 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  27.31 
 
 		 550 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.68 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  31.47 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  31.47 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  29.15 
 
 		 593 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  29.15 
 
 		 593 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  31.47 
 
 		 578 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  31.47 
 
 		 578 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  38 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.02 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  31.36 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  32.95 
 
 		 605 aa  77  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  27.17 
 
 		 582 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.3 
 
 		 580 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  30.91 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  33.65 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  32.03 
 
 		 618 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  29.3 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  33.76 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  37.5 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.8 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  32.64 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  28.4 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  34.25 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.08 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  29.31 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  31.25 
 
 		 577 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  30 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  38.79 
 
 		 743 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  28.29 
 
 		 558 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  30.36 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  28.74 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  24.73 
 
 		 571 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  31.49 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  34.31 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  26.1 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  33.55 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  25.62 
 
 		 601 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  27.44 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  34 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  39.36 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  25.66 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  39.36 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  40.43 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.01 
 
 		 714 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.21 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  27.86 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  30.21 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.26 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  28.43 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  31.29 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  33.61 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  24.55 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  33.14 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  23.37 
 
 		 516 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  40.43 
 
 		 535 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  34.07 
 
 		 117 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>