124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0183 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  100 
 
 		 417 aa  839    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  92.07 
 
 		 418 aa  784    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  91.83 
 
 		 418 aa  783    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 469 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  29.82 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  29.69 
 
 		 442 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  40.86 
 
 		 661 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  33.12 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  37.11 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  30.08 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  31.98 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  28.23 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.8 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  43.3 
 
 		 620 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  31.58 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  36.36 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  30.7 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  36.8 
 
 		 627 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  26.48 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  33.51 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  34.05 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  34.05 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  35.22 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  33.15 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  30.89 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  25.27 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  35.85 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  27.44 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  37.5 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  37.5 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  26.65 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  36.67 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  36.67 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  37.5 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  36.67 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  36.67 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  30.27 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  35.71 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  36.67 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  30.27 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  36.67 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  36.67 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  36.67 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  26.96 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  37.5 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  35.83 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  26.73 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  37.07 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  37.25 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  26.65 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  26.65 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  26.42 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  28.14 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 565 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  24.38 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  24.38 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  24.53 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  26.23 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  37.25 
 
 		 526 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  29.44 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  29.44 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  43.66 
 
 		 142 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  29.44 
 
 		 493 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  26.1 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  26.02 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  29.47 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  29.01 
 
 		 568 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  29.01 
 
 		 620 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  28.24 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  24.56 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  25.71 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  25.71 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  28.31 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  34.83 
 
 		 497 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  34.83 
 
 		 513 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  28.24 
 
 		 526 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  34.83 
 
 		 518 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  26.92 
 
 		 585 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  33.68 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  34.83 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  28.79 
 
 		 506 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  40.51 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 228 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  45.65 
 
 		 571 aa  49.7  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  40.28 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  25.44 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  36.26 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  26.98 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  34.21 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  29.53 
 
 		 714 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  26.47 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  39.24 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  27.06 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  32.65 
 
 		 458 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  25.19 
 
 		 507 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  27.51 
 
 		 501 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>