113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1709 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1030    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  93.29 
 
 
507 aa  902    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  96.62 
 
 
355 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1030    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  93.29 
 
 
507 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  89.79 
 
 
519 aa  905    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  77.98 
 
 
510 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  77.64 
 
 
508 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  78.54 
 
 
508 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  76.36 
 
 
511 aa  728    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1030    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  72.17 
 
 
552 aa  775    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  93.29 
 
 
507 aa  906    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  90.75 
 
 
519 aa  914    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  76.89 
 
 
489 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  80.62 
 
 
506 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  76.59 
 
 
501 aa  736    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  47.02 
 
 
495 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  45.89 
 
 
518 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  45.4 
 
 
513 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  45.72 
 
 
464 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  45.89 
 
 
497 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  47.19 
 
 
451 aa  360  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  45.26 
 
 
499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  45.34 
 
 
454 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  43.83 
 
 
444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  43.83 
 
 
444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  43.98 
 
 
492 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  44.22 
 
 
454 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  43.11 
 
 
492 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  43.11 
 
 
492 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  43.88 
 
 
446 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  42.95 
 
 
444 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  42.92 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  43.11 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  42.54 
 
 
442 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  42.54 
 
 
442 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  42.64 
 
 
490 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  44.5 
 
 
447 aa  316  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  43.4 
 
 
448 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  41.81 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  41.81 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  42.92 
 
 
448 aa  309  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  50.95 
 
 
317 aa  269  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  73.42 
 
 
158 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  37.97 
 
 
531 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  52.3 
 
 
239 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  36.88 
 
 
532 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  37.75 
 
 
540 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  37.35 
 
 
437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  33.98 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  33.62 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  51.46 
 
 
240 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  34.29 
 
 
593 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  33.49 
 
 
524 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  33.33 
 
 
534 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  33.58 
 
 
533 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  31.55 
 
 
546 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  32.03 
 
 
387 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.03 
 
 
561 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  29.48 
 
 
442 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  28.09 
 
 
469 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  31.72 
 
 
485 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  26.48 
 
 
432 aa  93.2  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  27.53 
 
 
572 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  36.89 
 
 
469 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  33.33 
 
 
661 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  26.68 
 
 
627 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  38.64 
 
 
260 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  26.59 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  37.12 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  27.1 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.36 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30.69 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  34.81 
 
 
494 aa  67  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  40.16 
 
 
222 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  24.82 
 
 
414 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.18 
 
 
414 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  25.68 
 
 
275 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  41.33 
 
 
87 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  41.33 
 
 
87 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  36.29 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  24.28 
 
 
505 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  26.11 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  29.38 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  26.71 
 
 
526 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  28.75 
 
 
433 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  28.75 
 
 
428 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  29.38 
 
 
440 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  28.75 
 
 
433 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  29.41 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  28.75 
 
 
436 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  26.25 
 
 
577 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5104  hypothetical protein  39.53 
 
 
96 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  28.12 
 
 
433 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5192  hypothetical protein  39.53 
 
 
104 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5483  hypothetical protein  39.53 
 
 
104 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  25.82 
 
 
418 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  27.16 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>