216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  100 
 
 		 628 aa  1230    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  41.32 
 
 		 558 aa  353  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  40.82 
 
 		 580 aa  347  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  62.65 
 
 		 530 aa  303  9e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  66.48 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  61.5 
 
 		 499 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  60.18 
 
 		 551 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  58.13 
 
 		 535 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  52.22 
 
 		 580 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  50.28 
 
 		 584 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  41.85 
 
 		 714 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  43.46 
 
 		 602 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  39.09 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  53.03 
 
 		 603 aa  145  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  43.95 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  44.59 
 
 		 556 aa  134  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.89 
 
 		 585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  37.55 
 
 		 222 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  44.3 
 
 		 620 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  41.28 
 
 		 507 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  43.31 
 
 		 568 aa  128  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  40.51 
 
 		 748 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  37.89 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 485 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  34.55 
 
 		 510 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 567 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 443 aa  97.8  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  38.56 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  37.21 
 
 		 516 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 469 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  36.94 
 
 		 637 aa  95.1  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  44.74 
 
 		 310 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  37.16 
 
 		 360 aa  87.8  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  36.78 
 
 		 484 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  36.78 
 
 		 567 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  33.48 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 169 aa  83.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  40.48 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  40.8 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  40.8 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  39.22 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  40 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  43.27 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  31.49 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  43.27 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  31.49 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  31.33 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  31.49 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  40.32 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  38.56 
 
 		 480 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  32.73 
 
 		 561 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  40.32 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  38.56 
 
 		 480 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  38.27 
 
 		 561 aa  80.1  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  37.04 
 
 		 228 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  36.6 
 
 		 620 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  39.2 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  37.88 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  35.86 
 
 		 539 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  44.55 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  42.52 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  34.73 
 
 		 198 aa  75.5  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  36.03 
 
 		 661 aa  75.5  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  37.4 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  42.45 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  33.57 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  41.58 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  37.8 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.51 
 
 		 553 aa  73.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  36.13 
 
 		 743 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  47.25 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  34.87 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  35.14 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  30.46 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  36.76 
 
 		 572 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  32.58 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  31.29 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  34.38 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  32.39 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  42.57 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  42.57 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  42.57 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  42.57 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  48.65 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  42.57 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  42.57 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  42.57 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  31.98 
 
 		 473 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  42.57 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  42.57 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  38 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  38 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  32.12 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  41.58 
 
 		 532 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  40.59 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  33.94 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  28.51 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>