166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0067 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  100 
 
 		 458 aa  936    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  45.39 
 
 		 472 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  35.4 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  35.75 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  31.36 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2095  hypothetical protein  54.72 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  27.37 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  26.85 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  26.85 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  26.48 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  26.85 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  26.85 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  26.85 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  26.85 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  25.94 
 
 		 440 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  28.84 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  26 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  26 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  25.65 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  25.65 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  25.81 
 
 		 408 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  25.7 
 
 		 418 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  28.78 
 
 		 485 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  25.56 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  25.56 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  25.75 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  26.84 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.4 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  25.6 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  25.06 
 
 		 489 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  25.25 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  24.37 
 
 		 620 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  39.34 
 
 		 661 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  24.44 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  24.44 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  25.52 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.63 
 
 		 561 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  30.86 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  36.13 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  42.37 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  43.22 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  40 
 
 		 627 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  32.79 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  42.37 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  38.46 
 
 		 572 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  24.37 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.76 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  26.79 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  23.87 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  34.21 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  35.09 
 
 		 255 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  34.55 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  39.36 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  45.78 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  29.24 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  25.89 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  39.8 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  35.4 
 
 		 508 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  35.4 
 
 		 222 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  43.21 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  34.82 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  42.5 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  42.5 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  47.62 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.19 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  47.62 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  37.36 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.84 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.85 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  49.21 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.63 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  47.62 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  47.62 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  47.62 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  46.77 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  46.77 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  35.24 
 
 		 558 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  46.03 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  35.24 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  47.62 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  35.24 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  46.03 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  46.77 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  46.03 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  46.77 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  34.74 
 
 		 497 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  32.98 
 
 		 513 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  34.74 
 
 		 518 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  34.74 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  32.98 
 
 		 495 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  44.44 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  33.63 
 
 		 556 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  30.97 
 
 		 538 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  30.09 
 
 		 585 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  34.69 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  33.64 
 
 		 551 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  30.09 
 
 		 566 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  24.47 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  37.66 
 
 		 511 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>