222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2222 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  100 
 
 		 485 aa  943    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  74.36 
 
 		 469 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  36.83 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  37.19 
 
 		 432 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.14 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  30.83 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  42.19 
 
 		 494 aa  147  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  40 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  38.11 
 
 		 526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  36.02 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  43.75 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  37.55 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  36.68 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 417 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  39.06 
 
 		 505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  36.17 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  30.79 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  43.21 
 
 		 661 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  31.49 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  42.51 
 
 		 627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  41.38 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  40.51 
 
 		 580 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 580 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 584 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  36.53 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  41.78 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  49.49 
 
 		 620 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  38.07 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  28.63 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  28.34 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  41.04 
 
 		 558 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 628 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  30.29 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  41.84 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  34.29 
 
 		 499 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  35.85 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  28.16 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  36.87 
 
 		 518 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  28.57 
 
 		 506 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  28.65 
 
 		 577 aa  92  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  32.46 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  28.78 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  37.23 
 
 		 495 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  27.5 
 
 		 519 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  27.44 
 
 		 522 aa  90.1  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  36.67 
 
 		 513 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  27.29 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  27.08 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  38.89 
 
 		 435 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  26.37 
 
 		 551 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  27.08 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  38.89 
 
 		 435 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  27.08 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  32.02 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  27.29 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  32.02 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  27.29 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  27.61 
 
 		 526 aa  88.2  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  32.46 
 
 		 448 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  32.02 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  32.02 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  33.33 
 
 		 454 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  31.58 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  32.02 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  31.58 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  31.58 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  30.7 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  32.02 
 
 		 493 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  27.08 
 
 		 507 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  31.58 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 551 aa  86.7  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  31.58 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  31.58 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  31.4 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  27.59 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  40.48 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  34.98 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  28.33 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  34.98 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  27.9 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  28.43 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  34.62 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  38.94 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  26.28 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  28.13 
 
 		 501 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  48.98 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  36.76 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  27.27 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  45.19 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  37.79 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  47.96 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  47.96 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  34.66 
 
 		 593 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  47.96 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  37.69 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  35.12 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  47.96 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>