170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3830 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1019    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  58.28 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  29.41 
 
 		 510 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  30.97 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  29.92 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  29.32 
 
 		 567 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.92 
 
 		 580 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  30.38 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.52 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.38 
 
 		 443 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  41.81 
 
 		 748 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  30.18 
 
 		 556 aa  103  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  29.86 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  30.28 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.43 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  37.27 
 
 		 714 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 620 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  33.65 
 
 		 530 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  39.46 
 
 		 637 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  28.35 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  30.79 
 
 		 310 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.88 
 
 		 628 aa  87.8  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 602 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 743 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  40.31 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  40.77 
 
 		 580 aa  85.1  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  35.75 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.92 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.92 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  35.12 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  38.76 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  32.82 
 
 		 526 aa  80.9  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  34.5 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  43.22 
 
 		 553 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  32.33 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  32.43 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  27.99 
 
 		 568 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  38.04 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  35.95 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  28.3 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  31.79 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  42.37 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  29.92 
 
 		 480 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  29.92 
 
 		 480 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  29.61 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  24.29 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  33.58 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  25.99 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  27.17 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  27.17 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  39.47 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  32.46 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  35.76 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.91 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  39.6 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  42.31 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  29.34 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  42.31 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  25.94 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  42.31 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  41.35 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  40.38 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  41.35 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  40.38 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  28 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  26.8 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  36.3 
 
 		 169 aa  65.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  28 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  28 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  40.38 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  26.4 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  25 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  26.4 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  26.4 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  26.8 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  28.31 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  26.86 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  27.95 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  25.8 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  27.43 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  25.61 
 
 		 579 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  26 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  26.61 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  27.25 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  26.77 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  26.88 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  24.93 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  26.05 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  25.9 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  26.48 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  32.97 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  30.1 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  27.19 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  32.88 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  37.25 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>