116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4397 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  76.14 
 
 
507 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  76.89 
 
 
507 aa  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  76.14 
 
 
507 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  76.89 
 
 
507 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  74.76 
 
 
519 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  76.53 
 
 
510 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  76.54 
 
 
508 aa  742    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  77.14 
 
 
508 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  74.54 
 
 
511 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  76.14 
 
 
507 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  69.29 
 
 
552 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  77.49 
 
 
507 aa  751    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  74.76 
 
 
519 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  82.77 
 
 
489 aa  791    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  91.36 
 
 
506 aa  856    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1012    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  79.14 
 
 
355 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  50.56 
 
 
451 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  45.95 
 
 
495 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  45.03 
 
 
518 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  44.74 
 
 
513 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  47.52 
 
 
454 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  46.38 
 
 
464 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  44.9 
 
 
497 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  44.81 
 
 
493 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  46.24 
 
 
499 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  44.25 
 
 
444 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  44.25 
 
 
444 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  44.49 
 
 
446 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  44.49 
 
 
492 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  46.68 
 
 
454 aa  343  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  44.2 
 
 
492 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  44.2 
 
 
492 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  43.81 
 
 
444 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  43.75 
 
 
442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  43.75 
 
 
442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  43.57 
 
 
473 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  43.14 
 
 
490 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  42.86 
 
 
447 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  42.21 
 
 
473 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  42.21 
 
 
473 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  44.25 
 
 
448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  44.01 
 
 
448 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  50.93 
 
 
317 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  53.09 
 
 
239 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  52.52 
 
 
240 aa  216  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  34.57 
 
 
551 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  33.26 
 
 
553 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  36.39 
 
 
531 aa  202  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  35.4 
 
 
532 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  36.21 
 
 
540 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  34.61 
 
 
524 aa  196  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  36.19 
 
 
437 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  64.78 
 
 
158 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  34.28 
 
 
593 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  34.07 
 
 
534 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  33.74 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  29.79 
 
 
561 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  29.9 
 
 
546 aa  126  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  32.57 
 
 
387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  27.7 
 
 
442 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  27.39 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  28.07 
 
 
572 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25.67 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.18 
 
 
661 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  27.63 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  39.85 
 
 
222 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  38.97 
 
 
260 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.32 
 
 
469 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  42.86 
 
 
222 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  25.43 
 
 
627 aa  73.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  25.91 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.35 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  44 
 
 
87 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30.41 
 
 
391 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  25.53 
 
 
428 aa  63.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  42.86 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  30.59 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  24.87 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  31.25 
 
 
440 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  30.63 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  25.46 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  25.45 
 
 
436 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  29.41 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  29.38 
 
 
433 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  26.09 
 
 
275 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  25.89 
 
 
526 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  24.78 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  29.19 
 
 
418 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5104  hypothetical protein  46.27 
 
 
96 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5192  hypothetical protein  46.27 
 
 
104 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5483  hypothetical protein  46.27 
 
 
104 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  28.04 
 
 
417 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  24.36 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  25.85 
 
 
577 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  37.21 
 
 
566 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  37.93 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  40.26 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>