154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3379 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1007    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  70.44 
 
 
513 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  72.04 
 
 
518 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  68.9 
 
 
464 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  69.26 
 
 
495 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  44.86 
 
 
489 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  41.99 
 
 
492 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  45.59 
 
 
507 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  41.99 
 
 
492 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  45.59 
 
 
507 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  45.89 
 
 
507 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  45.89 
 
 
507 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  42.19 
 
 
492 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  45.45 
 
 
519 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  45.89 
 
 
510 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  45.89 
 
 
507 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  46.62 
 
 
552 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  45.67 
 
 
507 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  45.67 
 
 
519 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  42.62 
 
 
473 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  42.16 
 
 
444 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  42.16 
 
 
444 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  42.11 
 
 
493 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  45.67 
 
 
508 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  44.88 
 
 
511 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  41.55 
 
 
444 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  41.39 
 
 
442 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  41.39 
 
 
442 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  44.9 
 
 
501 aa  359  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  41.48 
 
 
490 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  45.47 
 
 
506 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  41.68 
 
 
446 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  41.39 
 
 
473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  41.39 
 
 
473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  45.67 
 
 
508 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  43.45 
 
 
448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  42.34 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  43.22 
 
 
448 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  40.45 
 
 
451 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  42.51 
 
 
499 aa  310  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  41.65 
 
 
454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  42.92 
 
 
454 aa  297  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  41.69 
 
 
355 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  45.04 
 
 
317 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  55.4 
 
 
239 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  54.67 
 
 
240 aa  200  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  33.89 
 
 
553 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  33.59 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  33.5 
 
 
524 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  33.76 
 
 
540 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  32.61 
 
 
532 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  31.26 
 
 
531 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  33.1 
 
 
437 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  31.94 
 
 
593 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  31.58 
 
 
533 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  31.34 
 
 
534 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  57.14 
 
 
158 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  30.48 
 
 
387 aa  110  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  33.33 
 
 
485 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  27.01 
 
 
561 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  26.85 
 
 
546 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  29.1 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  34.54 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  29.66 
 
 
627 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  36.48 
 
 
572 aa  83.2  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  30.24 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  34.97 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  40.59 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  47.06 
 
 
494 aa  67  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  29.03 
 
 
407 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  37.62 
 
 
222 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  31.75 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  35.43 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  32.71 
 
 
442 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  31.96 
 
 
432 aa  60.1  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  30.52 
 
 
413 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  32.35 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  40.59 
 
 
222 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  35.65 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  35.65 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  35.65 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  27.36 
 
 
526 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  34.78 
 
 
436 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  29.61 
 
 
433 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  33.91 
 
 
438 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  33.91 
 
 
438 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  29.51 
 
 
433 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  34.74 
 
 
458 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.63 
 
 
566 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  30.23 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  35.09 
 
 
440 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  24.29 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  35.09 
 
 
256 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  31.61 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  30.23 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  32.79 
 
 
580 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  39.47 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>