74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23120 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1056    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  61.35 
 
 		 538 aa  588  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  60.97 
 
 		 526 aa  565  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  60.63 
 
 		 577 aa  561  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  57.77 
 
 		 524 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  47.17 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  44.27 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  31.47 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  30.59 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  31.73 
 
 		 414 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  30.89 
 
 		 255 aa  103  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.78 
 
 		 469 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  26.95 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  26.78 
 
 		 561 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  36.03 
 
 		 661 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  31.98 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  26.9 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  31.02 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  26.48 
 
 		 572 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  38.74 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  26.37 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  30.37 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  29.12 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  24.32 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  24.47 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  30.23 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  35.78 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  30.07 
 
 		 499 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  29.63 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  25.07 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  25.36 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  25.16 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  23.94 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  24.63 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  24.63 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  23.94 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  24.94 
 
 		 444 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  24.16 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  27.21 
 
 		 620 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  23.14 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  27.34 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  25.37 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  24.84 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  27.78 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  23.85 
 
 		 524 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  24.43 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  23.94 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  23.94 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  26.98 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  28.68 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  28.68 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  30 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  25.51 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  30 
 
 		 448 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  30 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  30 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  30 
 
 		 493 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  25.91 
 
 		 505 aa  47.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  28.86 
 
 		 464 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  29.09 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  30.16 
 
 		 593 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  26.33 
 
 		 518 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  25 
 
 		 513 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  27.45 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  27.97 
 
 		 458 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  38.46 
 
 		 508 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>