154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3050 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  1000    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  70.14 
 
 
497 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  85.19 
 
 
513 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  85.94 
 
 
518 aa  847    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  60.62 
 
 
464 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  47.3 
 
 
552 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  45.79 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  47.43 
 
 
507 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  47.43 
 
 
507 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  47.43 
 
 
507 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  47.02 
 
 
507 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  47.02 
 
 
507 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  47.22 
 
 
519 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  47.02 
 
 
507 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  47.43 
 
 
519 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  46.19 
 
 
510 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  46.6 
 
 
508 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  45.95 
 
 
501 aa  382  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  45.15 
 
 
508 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  45.8 
 
 
506 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  45.62 
 
 
511 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  43.78 
 
 
451 aa  355  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  46.49 
 
 
499 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  42.65 
 
 
444 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  42.03 
 
 
492 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  42.65 
 
 
444 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  42.03 
 
 
446 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  42.37 
 
 
447 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  41.31 
 
 
492 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  41.31 
 
 
492 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  44.79 
 
 
454 aa  344  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  42.03 
 
 
444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  41.25 
 
 
442 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  41.25 
 
 
442 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  41.2 
 
 
493 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  42.07 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  42.09 
 
 
448 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  42.42 
 
 
448 aa  339  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  46.2 
 
 
454 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  40.29 
 
 
490 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  40.8 
 
 
473 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  40.8 
 
 
473 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  44.41 
 
 
355 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  46.15 
 
 
317 aa  244  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  34.34 
 
 
553 aa  216  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  34.09 
 
 
540 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  32.92 
 
 
532 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  33.64 
 
 
551 aa  206  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  32.13 
 
 
531 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  47.29 
 
 
239 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  34 
 
 
437 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  46.57 
 
 
240 aa  196  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  31.8 
 
 
524 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  31.81 
 
 
593 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  31.21 
 
 
534 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  30.97 
 
 
533 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  56.12 
 
 
158 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  28.53 
 
 
387 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.72 
 
 
469 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  26.63 
 
 
561 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  26.42 
 
 
546 aa  105  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  37.23 
 
 
485 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  41.73 
 
 
260 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  39.57 
 
 
222 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  27.19 
 
 
572 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  42.65 
 
 
222 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.81 
 
 
661 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  52.63 
 
 
87 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  52.63 
 
 
87 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  52.63 
 
 
87 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  35.23 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  32.46 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  25.59 
 
 
627 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  33.33 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  29.51 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  31.28 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  31.89 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.06 
 
 
414 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  25.22 
 
 
414 aa  63.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  35.59 
 
 
464 aa  61.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  25.73 
 
 
442 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  32.63 
 
 
432 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  25.4 
 
 
458 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  33.91 
 
 
436 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  34.78 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  34.78 
 
 
435 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  34.78 
 
 
435 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.05 
 
 
566 aa  53.5  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  33.04 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  33.04 
 
 
438 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  42.67 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  28.11 
 
 
418 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  28.26 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  29.07 
 
 
433 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  28.21 
 
 
577 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  31.25 
 
 
580 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  31.9 
 
 
620 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  34.21 
 
 
440 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  40 
 
 
436 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  31.68 
 
 
507 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>