111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11604 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  95.4 
 
 
239 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  94.56 
 
 
317 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  69.92 
 
 
499 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  71.19 
 
 
454 aa  331  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  61.37 
 
 
451 aa  274  8e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  60.76 
 
 
454 aa  270  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  53.16 
 
 
489 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  54.04 
 
 
511 aa  228  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  53.97 
 
 
508 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  53.06 
 
 
508 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  52.72 
 
 
510 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  55.13 
 
 
552 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  52.3 
 
 
507 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  51.46 
 
 
507 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  51.46 
 
 
507 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  53.22 
 
 
506 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  51.88 
 
 
519 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  53.22 
 
 
501 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  51.46 
 
 
507 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  51.46 
 
 
507 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  51.46 
 
 
507 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  51.46 
 
 
519 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  49 
 
 
464 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  54.67 
 
 
497 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  46.91 
 
 
492 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  46.91 
 
 
492 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  47.92 
 
 
444 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  47.92 
 
 
444 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  47.92 
 
 
444 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  48.71 
 
 
473 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  46.57 
 
 
495 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  46.5 
 
 
493 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  50.42 
 
 
518 aa  194  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  46.09 
 
 
492 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  46.09 
 
 
446 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  50.63 
 
 
513 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  46.69 
 
 
447 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  47.13 
 
 
448 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  46.72 
 
 
448 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  47.41 
 
 
473 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  47.41 
 
 
473 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  44.44 
 
 
490 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  44.12 
 
 
442 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  44.12 
 
 
442 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  46.56 
 
 
540 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  44.92 
 
 
532 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  44.92 
 
 
531 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  44.92 
 
 
437 aa  138  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  43 
 
 
593 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  40.1 
 
 
553 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  39.05 
 
 
551 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  41 
 
 
524 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  42.25 
 
 
533 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  41.71 
 
 
534 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  51.13 
 
 
355 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  50 
 
 
158 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  52.87 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  30.24 
 
 
485 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.28 
 
 
561 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  31.37 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  31.5 
 
 
546 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  48.84 
 
 
87 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  48.84 
 
 
87 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  32.18 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  33.55 
 
 
661 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  32 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  31.72 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  31.38 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  33.15 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  32.18 
 
 
433 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  30.85 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  32.61 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  48.89 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  31.1 
 
 
572 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  31.98 
 
 
433 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  36.56 
 
 
494 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  30.23 
 
 
627 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  32.8 
 
 
442 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  31.53 
 
 
432 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  30.2 
 
 
464 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  26.52 
 
 
408 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30.95 
 
 
391 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  25.27 
 
 
407 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  26.75 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  28.12 
 
 
414 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  28.65 
 
 
522 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  25.69 
 
 
414 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  27.32 
 
 
418 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  34.04 
 
 
255 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  27.32 
 
 
418 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  38.16 
 
 
436 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  38.16 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  38.16 
 
 
440 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  39.13 
 
 
458 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  34.21 
 
 
566 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  27.03 
 
 
417 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  36.84 
 
 
435 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  34.78 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  36.84 
 
 
435 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>