108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4827 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  76.97 
 
 
507 aa  779    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  77.08 
 
 
507 aa  762    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  76.97 
 
 
507 aa  779    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  77.08 
 
 
507 aa  762    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  75.05 
 
 
519 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  90.52 
 
 
510 aa  884    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1035    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  94.49 
 
 
508 aa  963    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  89.24 
 
 
511 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  76.97 
 
 
507 aa  779    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  70.65 
 
 
552 aa  756    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  77.28 
 
 
507 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  75.34 
 
 
519 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  77.31 
 
 
489 aa  746    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  75.66 
 
 
506 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  76.54 
 
 
501 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  80.56 
 
 
355 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  45.28 
 
 
518 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  44.99 
 
 
513 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  48.05 
 
 
464 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  48.99 
 
 
451 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  45.15 
 
 
495 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  45.67 
 
 
497 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  44.81 
 
 
454 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  44.47 
 
 
499 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  45.12 
 
 
454 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  43.58 
 
 
492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  43.14 
 
 
492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  43.14 
 
 
492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  43.76 
 
 
446 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  43.14 
 
 
493 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  43.58 
 
 
444 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  43.58 
 
 
444 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  42.7 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  42.7 
 
 
444 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  42.12 
 
 
442 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  42.12 
 
 
442 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  43.06 
 
 
447 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  41.37 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  41.37 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  41.13 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  43.6 
 
 
448 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  43.1 
 
 
448 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  52.56 
 
 
317 aa  269  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  54.89 
 
 
239 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  53.97 
 
 
240 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  37.38 
 
 
540 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  36.14 
 
 
531 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  33.19 
 
 
551 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  35.4 
 
 
532 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  31.98 
 
 
553 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  35.73 
 
 
437 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  34.59 
 
 
524 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  61.88 
 
 
158 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  32.7 
 
 
593 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  32.43 
 
 
534 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  32.18 
 
 
533 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  33.55 
 
 
387 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  29.85 
 
 
546 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  29.05 
 
 
561 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  27.23 
 
 
442 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  28.44 
 
 
572 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  35.03 
 
 
661 aa  84.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  25.49 
 
 
627 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10096  hypothetical protein  37.31 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.493023  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  26.64 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  24.49 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  36.14 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  32.81 
 
 
469 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11605  REP13E12 repeat-containing protein  36.57 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.46537e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  26.28 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13503  hypothetical protein  40.98 
 
 
222 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.946921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  32.76 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  33.96 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  28.06 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  43.02 
 
 
87 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  43.02 
 
 
87 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  33.33 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  33.96 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  33.33 
 
 
428 aa  67  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  45.33 
 
 
87 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  33.33 
 
 
436 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  32.07 
 
 
428 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.78 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  32.7 
 
 
433 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  42.86 
 
 
494 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30.95 
 
 
391 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  27.43 
 
 
526 aa  61.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  27.35 
 
 
577 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  25.19 
 
 
418 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  25.84 
 
 
275 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  25.63 
 
 
418 aa  53.9  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  38.27 
 
 
464 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  41.33 
 
 
441 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5104  hypothetical protein  41.33 
 
 
96 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5192  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.783231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5483  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  25.29 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.97 
 
 
414 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1097  hypothetical protein  38.3 
 
 
111 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276681  normal  0.325571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>