146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2293 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  61.54 
 
 
532 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  61.81 
 
 
531 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  100 
 
 
540 aa  1087    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  62.89 
 
 
437 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  34.51 
 
 
553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  34.85 
 
 
524 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  34.12 
 
 
551 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  37.53 
 
 
451 aa  216  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  38.6 
 
 
499 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  36.08 
 
 
473 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  35.82 
 
 
444 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  35.82 
 
 
444 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  34.55 
 
 
492 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  34.55 
 
 
492 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  36.84 
 
 
454 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  38.5 
 
 
489 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  34.58 
 
 
493 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  31.83 
 
 
593 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  34.55 
 
 
442 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  34.55 
 
 
442 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  37.56 
 
 
519 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  37.56 
 
 
519 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  37.75 
 
 
507 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  37.75 
 
 
507 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  37.75 
 
 
507 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  34.55 
 
 
490 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  37.07 
 
 
552 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  37.35 
 
 
507 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  33.64 
 
 
446 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  33.64 
 
 
492 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  33.64 
 
 
473 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  33.64 
 
 
473 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  34.54 
 
 
444 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  37.62 
 
 
510 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  38.1 
 
 
454 aa  199  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  35.11 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  34.29 
 
 
495 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  37.38 
 
 
508 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  36.75 
 
 
508 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  34.84 
 
 
448 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  37.44 
 
 
511 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  33.07 
 
 
513 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  33.07 
 
 
518 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  33.78 
 
 
447 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  37.44 
 
 
506 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  36.21 
 
 
501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  33.76 
 
 
497 aa  183  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  31.6 
 
 
464 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  43.8 
 
 
317 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  31.28 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  31.28 
 
 
534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  36.26 
 
 
355 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  46.56 
 
 
240 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  46.56 
 
 
239 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2474  hypothetical protein  59.29 
 
 
115 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  31.25 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.25 
 
 
561 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  28.36 
 
 
546 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  26.49 
 
 
432 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  27.46 
 
 
442 aa  93.6  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  31.87 
 
 
572 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.83 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  30.33 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  34.9 
 
 
661 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  30.35 
 
 
627 aa  77.4  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  32.31 
 
 
464 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  45.45 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  28.12 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  25.84 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  25.97 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  27.59 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  33.99 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.34 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  27.95 
 
 
577 aa  70.1  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  31.93 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  28.1 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  39.8 
 
 
458 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  26.47 
 
 
538 aa  65.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  42.11 
 
 
255 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  37.01 
 
 
414 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  38.37 
 
 
441 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  37.21 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  37.21 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  37.21 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  37.21 
 
 
426 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  37.21 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  36.9 
 
 
440 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  36.05 
 
 
434 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  36.05 
 
 
430 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  35.71 
 
 
438 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  36.9 
 
 
435 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  35.71 
 
 
438 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  36.9 
 
 
435 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  36.9 
 
 
256 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  32.97 
 
 
428 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  30.73 
 
 
440 aa  57  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>