71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5365 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  330  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  97.47 
 
 
519 aa  321  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5365  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  73.42 
 
 
507 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  73.42 
 
 
507 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  73.42 
 
 
507 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  61.86 
 
 
552 aa  223  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  86.89 
 
 
507 aa  223  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  86.07 
 
 
507 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  86.07 
 
 
507 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  65 
 
 
508 aa  204  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  82.83 
 
 
510 aa  185  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  72.13 
 
 
501 aa  183  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  69.35 
 
 
508 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  81.73 
 
 
489 aa  180  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  70.99 
 
 
511 aa  174  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  82.8 
 
 
506 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  57.14 
 
 
497 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  56.12 
 
 
495 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  56.7 
 
 
518 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  52.04 
 
 
464 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  54.08 
 
 
513 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  51.02 
 
 
454 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  50.98 
 
 
317 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  52.04 
 
 
239 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  50 
 
 
240 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  48.98 
 
 
499 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  46.24 
 
 
451 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  46.74 
 
 
490 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  46.74 
 
 
444 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  46.74 
 
 
444 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  46.74 
 
 
448 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  46.74 
 
 
444 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  45.65 
 
 
447 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  44.33 
 
 
442 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  44.33 
 
 
442 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  45.36 
 
 
492 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  45.36 
 
 
492 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  45.65 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  44.33 
 
 
492 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  44.33 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  44.33 
 
 
493 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  44.57 
 
 
448 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  40.82 
 
 
454 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  43.48 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  43.48 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4317  hypothetical protein  42.67 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0667309  normal  0.918419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  39.77 
 
 
485 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  42.05 
 
 
469 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3799  hypothetical protein  41.33 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3872  hypothetical protein  41.33 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.709194  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  45.9 
 
 
593 aa  58.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  38.2 
 
 
561 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  36.26 
 
 
546 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  47.27 
 
 
494 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  38.46 
 
 
469 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  34.48 
 
 
572 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  34.09 
 
 
442 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  45.1 
 
 
540 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  38.3 
 
 
661 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  44.44 
 
 
534 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  41.82 
 
 
437 aa  44.3  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  37.14 
 
 
464 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  43.48 
 
 
533 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  36.51 
 
 
391 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  41.82 
 
 
441 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  43.14 
 
 
531 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  32.89 
 
 
432 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  36.36 
 
 
553 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  47.73 
 
 
627 aa  40.8  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  40.38 
 
 
532 aa  40.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>