136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3947 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  93 
 
 		 428 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  92.03 
 
 		 428 aa  761    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  93.59 
 
 		 433 aa  775    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  96.35 
 
 		 433 aa  793    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  92.89 
 
 		 440 aa  760    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  92.6 
 
 		 436 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  93 
 
 		 428 aa  770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  100 
 
 		 433 aa  871    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  32.63 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  28.87 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  28.87 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  28.83 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  28.87 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  28.87 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  28.87 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  30.6 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  28.87 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  28.87 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  28.1 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  28.18 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  28.47 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  28.18 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  30.69 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  30.69 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  23.66 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  32.24 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  28.4 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  32.24 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  26.12 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  26.12 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  31.15 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  31.69 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  32.18 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  32.18 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  25 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  26.6 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  39.81 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  32.7 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  25.29 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  33.73 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.21 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  24.29 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  24.74 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  24.29 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  33.96 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  28.48 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  25.56 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.58 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  33.74 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  29.65 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  31.61 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 620 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  33.82 
 
 		 568 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  33.6 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  30.82 
 
 		 508 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  28.65 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 627 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  23.95 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  29.38 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.8 
 
 		 605 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  31.39 
 
 		 620 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  32.26 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  23.27 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  31.79 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  30 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  25.42 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  31.46 
 
 		 540 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  30 
 
 		 507 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  24.51 
 
 		 531 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  32.09 
 
 		 585 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  24.07 
 
 		 505 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  24.93 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  29.03 
 
 		 661 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  33.7 
 
 		 572 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  35.2 
 
 		 499 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  32.67 
 
 		 584 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  30.9 
 
 		 317 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  29.19 
 
 		 551 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 551 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  25.09 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  34.4 
 
 		 580 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  24.35 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  34.4 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  33.6 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  25.71 
 
 		 519 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  29.17 
 
 		 507 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  26.33 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  30.52 
 
 		 556 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  29.17 
 
 		 519 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.65 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  31.06 
 
 		 524 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  29.65 
 
 		 553 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  28.57 
 
 		 518 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 577 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  28.65 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  28.65 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  32.69 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>