101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29150 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1003    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  52.64 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  47.86 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  43.61 
 
 		 561 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  44.35 
 
 		 577 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  54.84 
 
 		 360 aa  233  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  43.2 
 
 		 568 aa  100  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  32.64 
 
 		 620 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  34.35 
 
 		 556 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  42.4 
 
 		 566 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  32.63 
 
 		 567 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  40 
 
 		 585 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 714 aa  97.1  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  42.97 
 
 		 507 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  41.73 
 
 		 605 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  37.67 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  33.6 
 
 		 580 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  37.58 
 
 		 553 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.45 
 
 		 535 aa  90.9  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  30.8 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  39.57 
 
 		 580 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 602 aa  88.2  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  38.73 
 
 		 558 aa  87.8  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  35.83 
 
 		 508 aa  87.4  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  40.41 
 
 		 748 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  39.57 
 
 		 584 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  40.62 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 637 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  37.3 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  38.82 
 
 		 222 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  31.1 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 628 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  32.77 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 566 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  42.98 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.48 
 
 		 551 aa  73.6  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.25 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  27.22 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  27.33 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  33.09 
 
 		 743 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  41.77 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  41.1 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  33.55 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  25.88 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  30.32 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  26.82 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  29.68 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  32.9 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  32.9 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  29.68 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  32.79 
 
 		 512 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  30.32 
 
 		 440 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  29.68 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  29.68 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  29.65 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  29.68 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  29.68 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  33.85 
 
 		 550 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  25.38 
 
 		 405 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  31.37 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  31.25 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  23.92 
 
 		 464 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  31.53 
 
 		 198 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  25.98 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  28 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  31.28 
 
 		 485 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  34.78 
 
 		 572 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  33.7 
 
 		 557 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  22.92 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 519 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 709 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  33.7 
 
 		 602 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  23.42 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  28.93 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  25 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  22.42 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  28.68 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 535 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  31.9 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  31.9 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  31.9 
 
 		 578 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  30.83 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  30.2 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  25.07 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  30.83 
 
 		 524 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  33.61 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  30.56 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  30.64 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  32.14 
 
 		 581 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  30 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  32.14 
 
 		 581 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  30 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  29.82 
 
 		 620 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  24.01 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  34.09 
 
 		 578 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  28.87 
 
 		 169 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  22.94 
 
 		 546 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  29.93 
 
 		 256 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>