88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  87.8 
 
 		 561 aa  924    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1149    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  44.35 
 
 		 502 aa  323  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  43.16 
 
 		 521 aa  316  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  40.68 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 360 aa  189  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  41.52 
 
 		 553 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  35 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 603 aa  88.2  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  40.48 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  39.84 
 
 		 556 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.94 
 
 		 426 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.53 
 
 		 567 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  38.58 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 748 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 714 aa  84  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  37.8 
 
 		 568 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 602 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 605 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  36.22 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  39.68 
 
 		 530 aa  80.1  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 558 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  39.44 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  39.37 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  39.37 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  39.84 
 
 		 637 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  39.37 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  36.08 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  38.58 
 
 		 580 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  39.83 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  26.69 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  38.35 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  38.02 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  34.4 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  34.69 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.77 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  37.19 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  40 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  42.67 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  37.19 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  25.71 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  25.71 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  33.62 
 
 		 198 aa  54.7  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 169 aa  52.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  25.24 
 
 		 434 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  32.76 
 
 		 481 aa  52  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 433 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 436 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 433 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 428 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  33.68 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.86 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 743 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  33.09 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 485 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 709 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  40.3 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  25.49 
 
 		 474 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  31.37 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.6 
 
 		 464 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  33.75 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  32.12 
 
 		 403 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  24.21 
 
 		 426 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  35.82 
 
 		 593 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  24.06 
 
 		 436 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  35.82 
 
 		 593 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  32.5 
 
 		 557 aa  44.3  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  32.47 
 
 		 602 aa  44.3  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  31.39 
 
 		 405 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  35.82 
 
 		 581 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  30.88 
 
 		 405 aa  43.9  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  35.82 
 
 		 581 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  40 
 
 		 496 aa  43.9  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  35.82 
 
 		 578 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>