142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  100 
 
 		 360 aa  716    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  53.58 
 
 		 502 aa  259  7e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  47.78 
 
 		 523 aa  229  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  50.78 
 
 		 521 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  42.43 
 
 		 577 aa  209  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  41.78 
 
 		 561 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 602 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  41.84 
 
 		 714 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  41.86 
 
 		 603 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 566 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.97 
 
 		 553 aa  96.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  40.65 
 
 		 508 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  40.74 
 
 		 568 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  38.41 
 
 		 620 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 580 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  37.96 
 
 		 580 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 585 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 605 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 558 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  38.69 
 
 		 584 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  37.96 
 
 		 535 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  37.96 
 
 		 499 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  42.75 
 
 		 507 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  36.24 
 
 		 510 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  40.3 
 
 		 556 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.16 
 
 		 628 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  36.67 
 
 		 530 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  32 
 
 		 567 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  43.7 
 
 		 551 aa  86.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  39.23 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  42.98 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  37.59 
 
 		 748 aa  80.1  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  39.67 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 637 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  42.15 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  38.84 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  37.5 
 
 		 579 aa  72.8  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 566 aa  72.8  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  42.47 
 
 		 618 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  35.34 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.26 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  36 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  41.98 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  41.98 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  33.59 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  33.59 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  35.26 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  45.95 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  33.51 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 535 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 433 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 586 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  28.36 
 
 		 464 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  40.74 
 
 		 572 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  43.06 
 
 		 519 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  43.06 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  39.51 
 
 		 602 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  32.59 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  32.59 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  43.06 
 
 		 524 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  39.51 
 
 		 557 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  28.47 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  38.89 
 
 		 539 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  32.59 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 593 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  37.5 
 
 		 593 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  38.24 
 
 		 519 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  33.67 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  37.5 
 
 		 578 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  33.67 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  37.5 
 
 		 578 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  31.5 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  37.68 
 
 		 620 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  38.24 
 
 		 581 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  32.65 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  38.24 
 
 		 581 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  37.5 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 578 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  27.05 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  38.82 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  32.04 
 
 		 546 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 488 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  30.84 
 
 		 620 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  30.71 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  30.71 
 
 		 492 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 498 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 516 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  29.93 
 
 		 473 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  38.36 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  33.01 
 
 		 469 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  29.92 
 
 		 447 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  29.73 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  32.65 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>