182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  100 
 
 
504 aa  995    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  38.89 
 
 
441 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  31.36 
 
 
458 aa  170  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  33.33 
 
 
472 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  45.45 
 
 
572 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  47.78 
 
 
391 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  41.75 
 
 
661 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  28.64 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  29.01 
 
 
535 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  41.18 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  37.72 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  28.47 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  44.55 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  34.69 
 
 
437 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  41.07 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  36.04 
 
 
546 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  40.21 
 
 
561 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  44.55 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  40.18 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.54 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  37.3 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.37 
 
 
580 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  39.29 
 
 
414 aa  77  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  42.72 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  40 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  43.56 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  35.29 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  40.74 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  47.44 
 
 
142 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  42 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  35.38 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  35.38 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  36.15 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  36.15 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  37.8 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  42.16 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  39.29 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  35.23 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  38.46 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.56 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  40.62 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  34.39 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  35.88 
 
 
580 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  34.39 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  38.74 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.98 
 
 
584 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  36.15 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  38.17 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  38.83 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3452  HNH endonuclease  40.54 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  33.53 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  33.53 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  36.15 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  36.64 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  40.59 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  38.6 
 
 
714 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  38.58 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  37.3 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  38.76 
 
 
508 aa  70.5  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  26.26 
 
 
558 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  38.74 
 
 
605 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  38.14 
 
 
603 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  38.1 
 
 
445 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  38.1 
 
 
445 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  32.78 
 
 
556 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  33.99 
 
 
567 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  40.98 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  34.04 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  31.28 
 
 
505 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  38.61 
 
 
628 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  40.91 
 
 
540 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  30.28 
 
 
526 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  33.01 
 
 
620 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  37.86 
 
 
530 aa  63.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  38.78 
 
 
447 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.84 
 
 
602 aa  63.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  39.8 
 
 
492 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  39.8 
 
 
492 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  40 
 
 
443 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  38.78 
 
 
446 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.33 
 
 
566 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  38.78 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  32.56 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  33.33 
 
 
585 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  40 
 
 
531 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  30.8 
 
 
620 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  37.76 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  38.82 
 
 
443 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  37.76 
 
 
473 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  39.58 
 
 
532 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  33.33 
 
 
568 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  39.33 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  38.78 
 
 
493 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  36.73 
 
 
444 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  36.73 
 
 
444 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  36.73 
 
 
444 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  36.73 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  36.73 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  38.04 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>