43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1849 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  614  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  49 
 
 
298 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  44.41 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  35.67 
 
 
298 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  35.41 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  30.85 
 
 
297 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  28.67 
 
 
290 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2760  restriction endonuclease-like protein  36.43 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  28.23 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  28.47 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  30.1 
 
 
290 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  28.25 
 
 
291 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  27.56 
 
 
283 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  27.61 
 
 
289 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  24.83 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  35.48 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  31.08 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  23.99 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  31.67 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  29.75 
 
 
326 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  26.4 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  26.61 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  27.98 
 
 
496 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  31.4 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  28.35 
 
 
256 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  29.27 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  31.67 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  26.45 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  28.12 
 
 
255 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  25.15 
 
 
271 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  27.1 
 
 
314 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  38.55 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  29.23 
 
 
253 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  29.2 
 
 
213 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  28.46 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  25.55 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20450  hypothetical protein with putative HNH endonuclease motif  40.91 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  28.57 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  35.9 
 
 
260 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  23.77 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  32 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>