87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3245 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  44 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  32.12 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  40.54 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  38.3 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  30.69 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  42.86 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  34.92 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  37.4 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  36.08 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  34.13 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  34.07 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  28.48 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  32 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  45.56 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  42.86 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  32.76 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  34.48 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  34.78 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  40.96 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  40.79 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  36.27 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  34.23 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  28.1 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  32.87 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  32.61 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  42.27 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  35.34 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  48.15 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  33.86 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  30.12 
 
 		 496 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  39.36 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  39.36 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  28.68 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  41.54 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  30.47 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  33.88 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  27.43 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  42.25 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  37.21 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  31.43 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  35.11 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  27.64 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  28.36 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  27.13 
 
 		 323 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3186  restriction endonuclease-like protein  27.13 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  32.06 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  33.7 
 
 		 374 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  37.35 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  31.13 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  41.98 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  46.43 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  36.05 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  36.05 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  36.05 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  32.98 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  42.31 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  42.67 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  29.6 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  29.66 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  32.8 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  30.85 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  41.89 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  34.09 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  22.3 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  34.02 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  34.69 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3271  hypothetical protein  34.12 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  32.23 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  30.2 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  29.69 
 
 		 437 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  32.17 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3178  restriction endonuclease-like protein  23.53 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2373  restriction endonuclease-like protein  31.68 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000067766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0418  restriction endonuclease-like protein  29.32 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1186  hypothetical protein  32.11 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0180  hypothetical protein  32.11 
 
 		 193 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7809  hypothetical protein  35.53 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1849  hypothetical protein  29.13 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00822295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  35.37 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  27.69 
 
 		 319 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>