36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6007 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  100 
 
 		 334 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  40.97 
 
 		 180 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  37.25 
 
 		 258 aa  95.9  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  38.73 
 
 		 252 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  37.14 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  38.16 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  39.23 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  31.3 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  38.46 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  34.32 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  37.96 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  35.11 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  33.06 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  33.12 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  35.16 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  30.25 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  32.28 
 
 		 256 aa  67  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  36.63 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  26.13 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  26.62 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  34.07 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  28.99 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  40.51 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  33.63 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  25.6 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  29.69 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  30.85 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  29.07 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  29.37 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  27.91 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  36.36 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  28.99 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  30.68 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  26.19 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>