78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1360 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  628  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  29.43 
 
 
257 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  30.88 
 
 
255 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  30.21 
 
 
260 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  28.77 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  29.37 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  29.62 
 
 
257 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  29.86 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  29.97 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  37.32 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  33.33 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  39.64 
 
 
265 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4900  HNH nuclease  30.99 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  35.71 
 
 
318 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  38 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  30.95 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  31.33 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4825  HNH nuclease  30.41 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  34.96 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  40.54 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  28.65 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  44 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  36.07 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  36.07 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  36.07 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  36.46 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  31.94 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  36 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  33.6 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  29.23 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  39.18 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  30.94 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  28.14 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  35.05 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  34.71 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  40.24 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  31.71 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.58 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2314  HNH nuclease  34.43 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  33.62 
 
 
462 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  40.74 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1677  hypothetical protein  32.52 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  31.88 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3691  hypothetical protein  32.09 
 
 
290 aa  62.4  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.905474  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  38.55 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  35.85 
 
 
259 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  31.01 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  29.63 
 
 
496 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  29.79 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  34.15 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  33.63 
 
 
334 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  36.59 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  36.59 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.89 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  37.08 
 
 
308 aa  55.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3723  hypothetical protein  25.98 
 
 
304 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  31.15 
 
 
297 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  29.03 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  32.22 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  27.5 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  28.57 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  29.25 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  30.08 
 
 
416 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  28.97 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  26.89 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5550  hypothetical protein  24.81 
 
 
454 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.463025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  29.37 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  27.56 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  27.89 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00960  hypothetical protein  31.71 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  27.72 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0038  hypothetical protein  24.71 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412041  hitchhiker  0.0000756142 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5076  HNH nuclease  25.19 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  29.76 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
424 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>